Laboratorij za organsku kemiju je u sastavu tadašnjeg Prehrambeno-tehnološkog odjela Tehnološkog fakulteta osnovan 1956. pod nazivom Zavod za organsku kemiju s tehnologijom. U vezi s reorganizacijom Sveučilišta ovaj je Laboratorij od 1975. do 1979. svrstan pod nazivom Laboratorij za primjenjenu organsku kemiju u OOUR Institut inženjerske kemije Tehnološkog fakulteta, a od 1979 g. djeluje kao Laboratorij za organsku kemiju u sastavu Prehrambeno-biotehnološkog fakulteta.